馬王政爭紛擾近一個月，國慶日當天民間團體兵分多路抗議，台大醫師柯文哲看馬政府未來執政，直言行政立法成為「光桿院長對上跛腳總統」，未來兩年國家殘廢。

「王金平這樣無法在喬事情了，因為現在無法代表國民黨來喬事情，所以他變成光桿院長，馬總統本來民調就很低，經過這件事情更低，所以他跛腳了，我想未來兩年台灣的政黨在行政與立法，光桿院長對上跛腳總統，國家差不多是殘廢了，你說怎麼辦？我也不曉得，就是大家自立自強。」